La recolección de mamíferos fue iniciada a mediados del Siglo XIX. Entre sus pioneros están A. V. Frantzius y W. Gabb, posteriormente, figuran C. Hoffmann, O. Salvin, y otros, incluyendo los nacionales A. Alfaro y J. C. Zeledón.

Los primeros grupos eran enviados a Estados Unidos o Europa. Muchos de los abundantes especímenes recolectados en esos primeros años dieron lugar a nuevas descripciones de roedores, murciélagos y otros grupos.  Fue necesaria la creación del Museo Nacional para contar con un lugar de depósito de los ejemplares, en suelo nacional.

Desde su creación hasta los años noventa, en el Siglo XX, la colección del Museo Nacional pasó por altibajos debido a factores económicos y sociales.  Incluso, en décadas anteriores la colección prácticamente estuvo abandonada. Fue hasta mediados de los noventa que se empezaron a destinar fondos para reactivarla.  Estando Bernal Rodríguez a cargo, se rescataron pieles, de las que se sabía poco, pero aún en buen estado. El catálogo original, al parecer, desapareció; no obstante, se reanudó la recolección.

Actualmente la colección de mamíferos consta de 1735 especímenes. Consiste en pieles y cráneos, pieles solas y cráneos sin piel.  Hay representadas 154 especies de los mamíferos del país, lo que equivale a un 65% de la mastofauna costarricense.

Los órdenes mejor representados son los murciélagos (Chiroptera), con 977 especímenes, lo que constituye un 58% de la colección.  Están representadas 94 especies de estos mamíferos, un 86% de las especies del país, que son 109 en total, lo que depende del criterio que los autores utilicen para hacer las clasificaciones.

Los roedores incluyen ratones, ardillas y el tepezcuintle (Rodentia), con 573 ejemplares, equivalente a un 34% de la colección.  Están representadas unas 30 especies de estos mamíferos, lo que corresponde al  67% de las especies de roedores del país, que son alrededor de 45.

Por último están los carnívoros (félidos, comadrejas, zorros grises, mapaches y otros), con 23 especímenes.  Esto constituye entre el 1 y el 2% de la colección.  Son 10 las especies representadas lo que significa un 43% de los carnívoros del país.  Entre los mamíferos, el 7% de la colección lo forman algunos ejemplares de otros órdenes donde están los zorros pelones, los monos, los animales de pezuñas, los insectívoros y los conejos.

En los últimos años se han efectuado recolectas de pieles a nivel de áreas de fragmentos de bosques en el Valle Central. Hay representación de pieles de murciélagos y ratones provenientes de Palmichal y Cedral de Acosta, áreas de la Zona Protectora Cerros de Escazú. Actualmente se trabaja en el inventario de mamíferos en el campo Escuela Iztarú, de la Zona Protectora Cerros de la Carpintera.  

Galería de imágenes de Mastozoología